HyperChem是一款以高質(zhì)量、靈活、易操作而聞名的分子模擬軟件,可通過3D對量子化學(xué)進行一個全面的計算,有著方便的模擬工具、美觀的圖形界面,可通過量子化學(xué)的半經(jīng)驗方法(AM1、PM3等)、從頭算方法(UHF、RHF、CI等)、密度泛函方法進行計算,進行單點能、幾何優(yōu)化、分子軌道分析、蒙特卡羅和分子力學(xué)計算、預(yù)測可見-紫外光譜等功能,為用戶更方便、簡潔的實現(xiàn)工作上的種種需求!
功能特點:
1、輸入結(jié)構(gòu)、讀取數(shù)據(jù)文件盒直接操作文字,以球、棍及其混合模式等不同方式顯示分子;
2、用量子化學(xué)或經(jīng)典勢能曲面方法。進行單點、幾何優(yōu)化和過度態(tài)尋找計算。
3、支持的計算方法有:從頭計算,半經(jīng)驗方法,分子力學(xué),混合計算等;
4、支持用戶定制的外部程序;
5、其他模塊:PAYTRACE模塊、RMSFit、SEQUENCE編輯器、晶體結(jié)構(gòu)器糖類結(jié)構(gòu)器、構(gòu)象搜尋、QSAR特效、腳本編輯器;
6、新的力場方法:Amber2、Amber3、用戶糖類的Amber、Amber94、Amber96;
破解方法:
1、下載程序并打開,
2、安裝完成后,進入軟件的主目錄;
3、將壓縮包中的CRACK壓縮包進行解壓,將里面的文件覆蓋在主目錄下面;
4、運行程序即可完成;
使用方法:
一、畫原子
1、打開Element Table對話框。這里有兩種方法:
在Build菜單中選擇Default Element,或者雙擊Drawing工具。DefaultElement對話框允許從周期表中選擇缺省元素。
2、如果單擊Properties...按鈕,將顯示當(dāng)前選擇元素的物理屬性。也可以
按下Shift鍵同時單擊元素按鈕,結(jié)果是一樣的。單擊OK鍵,物理屬性框消失。
3、如果Allow Ions或者Explicit Hydrogens打開(用對勾選擇),左鍵單擊這些選項使其關(guān)閉。
4、在缺省元素列表中選擇Carbon,接著關(guān)閉元素對話框。缺省元素將設(shè)置為碳。當(dāng)然也可以把打開的Default Element對話框移走,這樣可以看到HyperChem工作區(qū)。當(dāng)畫原子非常多的分子時,這是非常有效的。
5、左鍵單擊Drawing工具,把指針移到工作區(qū)。
6、左鍵單擊工作區(qū)左下角,將出現(xiàn)一個小圈,代表未成鍵的碳原子。
7、在工作區(qū)不同位置畫更多的原子。
二、畫價鍵
1、把指針移到剛才畫的第一個碳上。
2、按下鼠標左鍵。這是價鍵在第一個原子的位置。
3、保持鼠標按鈕按下的同時拖向工作區(qū)的頂端。
4、放開鼠標按鈕。這是價鍵在第二個原子的位置。一條線代表兩個碳原子之間的價鍵。
5、用仍舊停留在價鍵末端的指針, 用左鍵拖向工作區(qū)右下角。
6、放開鼠標按鈕。這是第三個原子的位置。
7、在空白工作區(qū)畫六個價鍵,形成一個環(huán)。
現(xiàn)在你清楚了如何畫原子和分子,并且學(xué)會了一些基本技巧。
三、選擇原子
在這個練習(xí)中,通過選擇原子,你可以學(xué)到基本的選擇技巧。首先必須設(shè)置選擇的級別[原子(atoms),基(residues),或分子(molecules)],這里設(shè)置為原子(atoms)。
1、左鍵單擊Select菜單。
2、左鍵單擊選擇Atoms。
接下來,關(guān)閉Multiple Selections:
1、左鍵單擊Select菜單。
2、如果Multiple Selections打開,左鍵單擊來關(guān)閉它。
這樣當(dāng)你重新選擇一個原子或者一組原子的時候,前面的選擇將會取消。
四、刪除原子
1、左鍵單擊Drawing工具進入繪圖模式。
2、右鍵單擊想要刪除的原子,或者想要刪除的價鍵中部。原子和價鍵就會消失。