AIMAll Pro v10.05.04 中文破解版

AIMAll Pro是一款功能強(qiáng)大、專業(yè)性強(qiáng)的量子化學(xué)軟件，什么是量子化學(xué)呢?量子化學(xué)在百度百科的定義就是應(yīng)用量子力學(xué)的基本原理和方法研究化學(xué)問題的一門基礎(chǔ)科學(xué)。研究范圍包括穩(wěn)定和不穩(wěn)定分子的結(jié)構(gòu)、性能及其結(jié)構(gòu)與性能之間的關(guān)系;分子與分子之間的相互作用;分子與分子之間的相互碰撞和相互反應(yīng)等問題。小編也不是化學(xué)專業(yè)的，只能去百度百科為大家找找解釋了。這個(gè)軟件提供了多種量子化學(xué)相關(guān)工具，具有可靠和高效、定量和可視化的特性，能夠把QTAIM(分子原子量子理論)分析從分子波函數(shù)數(shù)據(jù)開始，逐步數(shù)據(jù)化的軟件。能夠正確確處理各種波函數(shù)類型：限制HF/KSDFT，限制開殼HF/KSDFT，無限制HF/KSDFT，限制MP2/CCSD/等，無限制MP2/CCSD/等，CASSCF，CIS，磁性(GIAO/CSGT)擾動(dòng)HF/KSDFT等。軟件還擁有多處理器計(jì)算功能和所有與可視化相關(guān)的功能，比如：編寫和顯示分子圖，能夠使用超過12個(gè)原子或超過400個(gè)原始基函數(shù)的波函數(shù)。能夠在具有3個(gè)以上波函數(shù)的“批處理模式”下運(yùn)行AIMQBGUI，并且計(jì)算出豐富多樣的屬性以及對(duì)所有重要結(jié)果進(jìn)行描述性整合處理，并且視圖化。一旦這個(gè)目標(biāo)合理地接近實(shí)現(xiàn)，AIMAll的工作就會(huì)加速，包括對(duì)可視化組件(AIMStudio)的大量工作以及對(duì)AIMAll計(jì)算的共享內(nèi)存多處理器支持。AIMAll有一個(gè)名為AIMStudio的可視化組件，它允許所有AIMAll的計(jì)算結(jié)果在3D窗口和可定制的表格中交互。軟件能夠在Windows，MacOSX和Linux上完全正常運(yùn)行，并且能夠把處理相關(guān)的量子化學(xué)成像化，讓用戶更加清楚的知道量子化學(xué)的基本原理和實(shí)現(xiàn)的效果。

安裝破解教程

1、在本站下載安裝包;

2、開始安裝;

3、選擇我同意相關(guān)協(xié)議;

4、選擇安裝路徑;

5、正在安裝;

6、安裝完成;

7、如圖所示，打開文件安裝位置;

8、找到破解補(bǔ)丁;

9、把補(bǔ)丁復(fù)制進(jìn)去即可;

10、打開軟件。

軟件功能

1、強(qiáng)大的支持和定期更新;

2、支持各種原子軌道;

3、加快計(jì)算和做事情;

4、支持不同的操作系統(tǒng)。

軟件特色

一、計(jì)算功能

在Windows，MacOSX和Linux上完全正常運(yùn)行。

易于使用的GUI和命令行界面，用于設(shè)置和運(yùn)行部分或完整的AIM分析。

完整的GUI支持，可輕松設(shè)置和運(yùn)行多個(gè)串聯(lián)波函數(shù)的AIMAll計(jì)算(“批處理模式”)。

全自動(dòng)，可靠，穩(wěn)健，準(zhǔn)確，相對(duì)快速，高效地計(jì)算電子密度拓?fù)浜退性犹匦浴?/p>

如有必要，自動(dòng)調(diào)整原子積分方法和/或原子積分參數(shù)，以始終實(shí)現(xiàn)良好的原子積分精度。

支持傳統(tǒng)的AIM波函數(shù)文件(.wfn)，擴(kuò)展的AIM波函數(shù)文件(.wfx)和高斯(g03或g09)格式的檢查點(diǎn)文件作為輸入。

無限的波函數(shù)大小，即無限數(shù)量的原子，MO和基函數(shù)。

正確處理各種波函數(shù)類型：限制HF/KSDFT，限制開殼HF/KSDFT，無限制HF/KSDFT，限制MP2/CCSD/等，無限制MP2/CCSD/等，CASSCF，CIS，磁性(GIAO/CSGT)擾動(dòng)HF/KSDFT等

將高斯格式化檢查點(diǎn)文件自動(dòng)轉(zhuǎn)換為擴(kuò)展或傳統(tǒng)AIM波形函數(shù)文件。

自動(dòng)驗(yàn)證有時(shí)有問題的傳統(tǒng)波函數(shù)文件和擴(kuò)展波函數(shù)文件。

對(duì)于任何類型的計(jì)算，支持波函數(shù)擴(kuò)展為S，P，D，F(xiàn)，G和H高斯基函數(shù)類型。

當(dāng)波函數(shù)包括用于ECP建模的核心電子的附加核心密度函數(shù)數(shù)據(jù)時(shí)，支持使用有效核心勢(shì)(ECP)的計(jì)算得到的波函數(shù)。

信息性，可定制的日志窗口顯示計(jì)算進(jìn)度。

共享內(nèi)存，多處理器/多核支持所有重要的計(jì)算步驟。

能夠使用多個(gè)共享內(nèi)存處理器/內(nèi)核一次無縫地計(jì)算多個(gè)原子。

電子密度分布的自動(dòng)和徹底的拓?fù)浞治觯ň哂蟹浅?fù)雜拓?fù)涞哪切?/p>

豐富的電子密度臨界點(diǎn)和路徑描述符，包括所有CP(和核)的電子密度，BCP的橢圓度，所有CP的能量密度，所有CP(和核)的總靜電勢(shì)，所有CP的應(yīng)力張量數(shù)據(jù)，鍵合路徑長(zhǎng)度，鍵合路徑角度等。

自動(dòng)計(jì)算和保存完整的分子圖形可視化。

所有電子密度臨界點(diǎn)和路徑屬性都有用地匯總在易于閱讀，自描述的文本文件和相應(yīng)的可視化文件中。

全自動(dòng)分析拉普拉斯算子的電子密度分布的拓?fù)涮卣?，包括所有臨界點(diǎn)及其性質(zhì)以及原子圖路徑。

各種功能的交互式拓?fù)浞治?，包括維里場(chǎng)，磁感應(yīng)電流密度分布和單個(gè)分子軌道。

自動(dòng)，完整地設(shè)置和提交所有原子集成計(jì)算。

同時(shí)原子盆地和原子表面性質(zhì)計(jì)算。

提供多種獨(dú)立的原子集成算法，用于內(nèi)部驗(yàn)證和處理特別困難的情況。

原子電荷，偶極矩貢獻(xiàn)，四極矩，徑向矩和徑向畸變矩。

原子動(dòng)能，勢(shì)能，總能量和拉格朗日。

完整而準(zhǔn)確地實(shí)現(xiàn)IQA(交互量子原子)，包括Vee(A，B)術(shù)語(yǔ)，用于Hartree-Fock，LSDA和B3LYP以及M062X波函數(shù)。

原子體積和原子表面積，包括原子間表面區(qū)域(等距密度表面)和原子等密度表面區(qū)域。

原子電子定位指數(shù)(LIs)和離域指數(shù)(DIs，債券訂單)。

計(jì)算原子靜電相互作用能的所有成分。

可選計(jì)算原子Ehrenfest力和原子Feynman力。

可選計(jì)算對(duì)庫(kù)侖，交換和總雙電子能量的原子貢獻(xiàn)。

可選計(jì)算原子磁響應(yīng)特性，如凈電流，磁化率，NMR屏蔽張量(包括NIC)等。

原子笛卡爾矩的電子密度分布通過5階。

原子球諧波矩的電子密度分布為任意階數(shù)(默認(rèn)情況下高達(dá)l=5，根據(jù)要求可提高)。

計(jì)算原子間表面性質(zhì)和原子間表面文件的寫入，以便在以后的計(jì)算中可視化和可能的重復(fù)使用。

計(jì)算原子等密度表面(IDS)特性，包括面積和靜電勢(shì)特性。

用于研究開殼系統(tǒng)的原子電子自旋種群和其他自旋特性。

原子源對(duì)所有電子密度臨界點(diǎn)和所有原子核的電子密度的貢獻(xiàn)。

所有原子屬性都在一個(gè)易于閱讀，自描述的文本文件和相應(yīng)的可視化文件中進(jìn)行了有用的匯總和制表。

二、可視化功能

在Windows，MacOSX和Linux上完全正常運(yùn)行。

現(xiàn)代3D(OpenGL)可視化應(yīng)用程序(AIMStudio)，用于交互式，完全可自定義的3D窗口顯示和所有AIMAll計(jì)算結(jié)果的表格顯示。

顯示可定制的分子圖，單獨(dú)或與任何相關(guān)的原子屬性，電子密度臨界點(diǎn)屬性，等高線圖，浮雕圖，等值面(原子和分子)，原子間表面，電子密度的拉普拉斯算子的臨界點(diǎn)和性質(zhì)等一起顯示。

在多個(gè)3D窗口和表格中顯示多個(gè)分子的結(jié)果，以便在任務(wù)之間輕松切換并輕松比較結(jié)果。

可分類，可復(fù)制，可打印的表格，適用于所有原子屬性，鍵臨界點(diǎn)屬性，環(huán)臨界點(diǎn)屬性，籠關(guān)鍵點(diǎn)屬性，非核吸引子屬性和電子密度臨界點(diǎn)屬性的拉普拉斯算子。

以各種流行格式保存3D窗口的高分辨率圖像文件，包括PNG，TIFF，JPEG，BMP和PDF。

打印3D窗口的高分辨率圖像。打印預(yù)覽可用。

易于計(jì)算和可定制的輪廓圖3D顯示(可按值分類，可根據(jù)用戶指定的位置和值標(biāo)簽的外觀)，浮雕圖(可按值分類)，2d彩色圖和等值面，用于各種功能，包括電子密度，拉普拉斯算子的電子密度，各種能量密度，總靜電勢(shì)(ESP)，電子自旋密度，單個(gè)分子軌道，磁感應(yīng)電流密度大小，Johnson等人的非共價(jià)相互作用(NCI)圖等。

能夠顯示磁感應(yīng)電流密度分布的矢量箭頭圖。

能夠?qū)⒁粋€(gè)函數(shù)顏色映射到另一個(gè)函數(shù)的等值面上，例如將ESP映射到電子密度等值面上，具有用戶可指定的布局和映射函數(shù)的值標(biāo)簽的外觀。

豐富的3D窗口顯示選項(xiàng)，包括可調(diào)節(jié)的背景顏色，可調(diào)節(jié)的球體半徑和每種對(duì)象類型的路徑/線寬，每種對(duì)象類型的可調(diào)節(jié)字體，每種對(duì)象類型(包括文本)的可調(diào)顏色和透明度，透視查看，抗鋸齒，可調(diào)節(jié)照明等

在3D窗口中單獨(dú)或按類型隱藏對(duì)象。

任何一組選定的核，BCP，RCP，CCP，NNACP或Ghosts的交互式距離表。

在視覺上區(qū)分弱粘合路徑。

完全可定制的文本文件查看器，用于查看和搜索詳細(xì)的結(jié)果文件

用戶定義的3D窗口文本注釋。

可定制顯示3D窗口中的一個(gè)或多個(gè)原子間表面和/或原子等密度表面和/或原子盆路徑組。

從同一波函數(shù)派生的任何可視化文件都可以在同一個(gè)3D窗口中輕松顯示。

可定制的交互式3D顯示和表格顯示關(guān)鍵點(diǎn)，關(guān)鍵點(diǎn)屬性和拉普拉斯電子密度的原子圖路徑。

常見問題

1、AIMAll是否對(duì)波函數(shù)的大小施加任何限制，即核，MO或原始函數(shù)的數(shù)量?

對(duì)AIMAll標(biāo)準(zhǔn)操作模式或AIMAll Professional操作模式的計(jì)算功能沒有限制。對(duì)于AIMAll標(biāo)準(zhǔn)操作模式，可視化相關(guān)功能和共享存儲(chǔ)器多處理器支持限制為12個(gè)原子或更少，400個(gè)原語(yǔ)或更少。使用AIMAll Professional操作模式對(duì)可視化相關(guān)功能或共享內(nèi)存多處理器支持沒有限制。

2、可以使用通過典型的Kohn-Sham DFT(KS-DFT)方法計(jì)算得到的波函數(shù)嗎?

是的，使用KS-DFT波函數(shù)計(jì)算和解釋大多數(shù)QTAIM屬性類似于Hartree-Fock波函數(shù)，使用合適的KS-DFT方法可能更準(zhǔn)確。為了計(jì)算基于原子DFT的交換相關(guān)能量和附加的IQA原子能量，目前唯一支持的KS-DFT方法是LSDA和B3LYP和M062X。必須使用標(biāo)簽(參見此處)在.wfx文件中指定.wfx波函數(shù)文件的基礎(chǔ)DFT模型，以便適當(dāng)?shù)赜?jì)算相應(yīng)的交換相關(guān)能量。

3、AIMAll是否支持使用多個(gè)處理器/核心?

是的，支持使用多個(gè)處理器(僅限共享內(nèi)存)可選地運(yùn)行AIMExt和AIMInt作業(yè))是可用的(非小波浪功能需要AIMAll Professional)。還支持使用多個(gè)處理器同時(shí)運(yùn)行多個(gè)AIMInt作業(yè)(即，一次計(jì)算多個(gè)原子)(非小波函數(shù)需要AIMAll Professional)。多處理器選項(xiàng)可通過AIMQB對(duì)話框中的“處理器”和“一次原子”字段或通過AIMQB的“-nproc”和“-naat”命令行參數(shù)指定。注意，對(duì)于小波函數(shù)最有效地使用多個(gè)處理器是一次計(jì)算多個(gè)原子(例如，-nproc = 3 -naat = 3)。對(duì)于大波函數(shù)，每個(gè)原子計(jì)算使用多個(gè)處理器變得有效(例如，-nproc = 3 -naat = 1)

4、如何用AIMAll計(jì)算原子磁響應(yīng)特性?

計(jì)算磁化張量和NMR屏蔽張量的原子貢獻(xiàn)要求在AIMQB的“磁響應(yīng)特性”組合框中選擇CSGTB，IGAIM或GIAO，以及使用CSGT磁波函數(shù)文件或GIAO磁波函數(shù)文件。

傳統(tǒng)AIM格式(.wfn)的CSGT磁波函數(shù)文件可以由Gaussian使用以下關(guān)鍵詞產(chǎn)生：nmr = csgt iop(10/21 = 1,99 / 6 = 200)output = wfn

擴(kuò)展格式的CSGT 磁波函數(shù)文件(.wfx)可以由Gaussian 09 Revision B.01及更高版本使用關(guān)鍵字：nmr = csgt output =(wfx，csgtcx)生成

必須手動(dòng)將關(guān)鍵字“CSGT”(不帶引號(hào))添加到傳統(tǒng)AIM格式的CSGT磁波函數(shù)文件的第2行(NUCLEI之后)的末尾，以便AIMAll知道它是CSGT波函數(shù)文件。

CSGT磁波函數(shù)可用于CSGTB和計(jì)算AIMAll中原子磁響應(yīng)特性的IGAIM方法。AIMAll中的CSGTB方法與Gaussian中實(shí)現(xiàn)的CSGT方法相同。AIMAll中的IGAIM方法(使用QTAIM原子)與高斯中的IGAIM方法不同，并且對(duì)于較小的基組，產(chǎn)生略微不同的總結(jié)果。

傳統(tǒng)AIM格式(.wfn)的GIAO磁波函數(shù)文件可以由Gaussian使用以下關(guān)鍵詞產(chǎn)生：nmr = giao iop(10/21 = 1,99 / 6 = 300)

擴(kuò)展格式(.wfx)的GIAO磁波函數(shù)文件可以由Gaussian 09 Revision B.01及更高版本使用關(guān)鍵字產(chǎn)生：nmr = giao output =(wfx，giaocx)

關(guān)鍵字“GIAO”(不帶引號(hào))必須是手動(dòng)添加到傳統(tǒng)AIM格式的GIAO波函數(shù)文件的第2行(NUCLEI之后)的末尾，以便AIMAll知道它是GIAO波函數(shù)文件。

AIMQB也可以通過打開由nmr = giao計(jì)算得到的高斯格式檢查點(diǎn)文件自動(dòng)生成擴(kuò)展AIM格式(.wfx)或傳統(tǒng)AIM格式(.wfn)的GIAO磁波函數(shù)文件。

5、sum文件中有關(guān)“重要”或“潛在重要”集成錯(cuò)誤的消息是什么意思?

理想情況下，計(jì)算的原子L(A)值應(yīng)為零，并且分子中所有原子的任何計(jì)算的原子性質(zhì)的總和當(dāng)然應(yīng)該等于已知的分子值。在實(shí)踐中，總會(huì)存在一些數(shù)值積分誤差，通常與原子表面的復(fù)雜性有關(guān)。

如果發(fā)生以下任何一種情況，“警告!重要...集成錯(cuò)誤...”消息將寫入總和文件：

原子A的計(jì)算L(A)值的大小> 0.01 au。

所有計(jì)算的L(A)值之和的大小> 0.01 au。

實(shí)際分子電荷與所有計(jì)算的原子電荷之和q(A)之差的大小> 0.01 au。

如果出現(xiàn)以下任何一種情況，“Note。潛在重要...集成錯(cuò)誤...”消息將寫入sum文件：

原子A計(jì)算的L(A)值的大小> 0.002 au和< 0.01 au。

所有計(jì)算的L(A)值之和的大小是> 0.002 au和< 0.01 au。

實(shí)際分子電荷與所有計(jì)算的原子電荷之和q(A)之差的大小是> 0.002 au和< 0.01 au。

“有效” 的0.01 au和“潛在有效”積分誤差的0.002 au 的閾值是合理的，但根據(jù)一個(gè)人的目的，可能過于保守或不夠保守。

注意，由于誤差的消除，計(jì)算的原子L(A)值可以(但不可能)在量值上非常小。

建議用戶自己監(jiān)測(cè)計(jì)算的原子特性的總和以及各個(gè)計(jì)算的L(A)值，并準(zhǔn)備好在必要時(shí)使用更高的正交和/或不同的原子積分算法重新計(jì)算“問題原子”。

6、何使用AIMAll計(jì)算分子中偶極子極化能力的張量?

分子偶極極化率張量的分量可以被計(jì)算為分子偶極矩分量相對(duì)于所施加電場(chǎng)的分量的一階導(dǎo)數(shù)，該導(dǎo)數(shù)在零場(chǎng)點(diǎn)處被評(píng)估。分子中的原子也是如此。為了計(jì)算原子偶極子衍生物，必須使用數(shù)值差異，因?yàn)樵颖砻?由電子密度分布限定)取決于電場(chǎng)。電子表格可能會(huì)有所幫助。

基本步驟是：

對(duì)感興趣的分子進(jìn)行常規(guī)的零場(chǎng)ab initio計(jì)算并生成相應(yīng)的波函數(shù)文件，例如molecular_0.wfn。

在molecular_0.wfn上運(yùn)行AIMAll以產(chǎn)生molecule_0.sum，其將包含零場(chǎng)點(diǎn)處分子的所有原子偶極矩。

在相同的幾何形狀，理論水平和基礎(chǔ)上進(jìn)行另一個(gè)ab initio計(jì)算分子，但是在存在沿+ X軸施加的小(例如0.0025 au)電場(chǎng)并產(chǎn)生相應(yīng)的波函數(shù)文件時(shí)，例如molecular_0025_x.wfn 。

在molecular_0025_x.wfn上運(yùn)行AIMAll以產(chǎn)生分子_0025_x.sum，其將包含在施加的電場(chǎng)存在下分子的所有原子偶極矩。

對(duì)于分子中的每個(gè)原子，計(jì)算原子極化率張量的XX，YX和ZX分量，作為原子偶極矩的X，Y和Z分量的變化除以沿X軸的外加電場(chǎng)的變化，即0.0025 au。

重復(fù)步驟3-5，但是沿著+ Y軸施加電場(chǎng)，以計(jì)算原子極化率張量的XY，YY和ZY元素。

重復(fù)步驟3-5，但是沿著+ Z軸施加電場(chǎng)，以計(jì)算原子極化率張量的XZ，YZ和ZZ元素。

考慮沿-X，-Y和-Z軸施加電場(chǎng)重復(fù)上述步驟。

考慮用較小(例如0.001 au)和較大(例如0.005 au)場(chǎng)強(qiáng)重復(fù)上述步驟。

7、如何在AIMStudio的3D窗口中使對(duì)象半透明?

通過使用對(duì)應(yīng)類型的相應(yīng)顏色對(duì)話框中的“Alpha通道”字段，可以在AIMStudio的3D窗口中使任何類型的對(duì)象(包括文本)半透明。Alpha通道值的范圍可以從255(不透明)到0(不可見)。大多數(shù)對(duì)象類型默認(rèn)是不透明的。

8、如何在AIMStudio中獲得更平滑的線條/路徑/曲線/文字?

抗鋸齒可能(取決于計(jì)算機(jī)圖形卡的質(zhì)量)改善路徑和點(diǎn)(以及可能的文本)的外觀(平滑度)。默認(rèn)情況下啟用抗鋸齒功能，但可以通過“查看 - >抗鋸齒”菜單項(xiàng)關(guān)閉。對(duì)于某些低端圖形系統(tǒng)，抗鋸齒可能效果不佳。在許多情況下，可以使用圖形系統(tǒng)的“控制面板”GUI調(diào)整圖形系統(tǒng)的抗鋸齒支持。或者，您可以選中“視圖 - >管狀線，曲線和路徑”菜單項(xiàng)，它將使用圓柱段而不是光柵化線段繪制線條，路徑和曲線。使用圓柱段的繪制線，路徑和曲線在屏幕和圖片(包括高分辨率)中看起來都很好但可能很昂貴。

9、如何在AIMStudio中的3D窗口中放大和縮小對(duì)象?

以下任何一種都可用于縮放：

使用鼠標(biāo)滾輪或觸摸板或魔術(shù)鼠標(biāo)滾動(dòng)機(jī)制。

使用鍵盤上的F5和F6鍵

按住鼠標(biāo)右鍵并按住Shift鍵水平移動(dòng)鼠標(biāo)

選擇“View-> Molecule Positioning-> Tools ...”菜單項(xiàng)以使用“Molecule Positioning Tools”對(duì)話框。

10、如何在AIMStudio中的3D窗口中旋轉(zhuǎn)對(duì)象?

可以使用以下任何一種旋轉(zhuǎn)：

通過按住鼠標(biāo)左鍵在窗口中左右移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，圍繞屏幕Y軸旋轉(zhuǎn)。

使用向左和向右箭頭鍵盤鍵圍繞屏幕Y軸旋轉(zhuǎn)。

通過按住鼠標(biāo)左鍵在窗口中來回移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，圍繞屏幕X軸旋轉(zhuǎn)。

使用向上和向下箭頭鍵盤鍵圍繞屏幕X軸旋轉(zhuǎn)。

通過按住鼠標(biāo)右鍵在窗口中左右移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，圍繞屏幕Z軸旋轉(zhuǎn)。

使用Page Up和Page Down鍵盤鍵圍繞屏幕Z軸旋轉(zhuǎn)。

選擇“View-> Molecule Positioning-> Tools ...”菜單項(xiàng)以使用“Molecule Positioning Tools”對(duì)話框。

11、如何在AIMStudio中的3D窗口中左/右/上/下移動(dòng)(平移)對(duì)象?

以下任何一種都可用于翻譯：

通過按住鼠標(biāo)中鍵(或可能是滾輪)在窗口中左右移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，沿著屏幕X軸移動(dòng)。

通過按住鼠標(biāo)左鍵并按住Shift鍵，在窗口中左右移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，沿屏幕X軸移動(dòng)。

按住Shift鍵，使用左右箭頭鍵盤鍵沿屏幕X軸移動(dòng)。

通過按住鼠標(biāo)中鍵(或滾輪)在窗口中上下移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，沿著屏幕Y軸移動(dòng)。

按住鼠標(biāo)左鍵并按住Shift鍵，在窗口中上下移動(dòng)鼠標(biāo)光標(biāo)，沿屏幕Y軸移動(dòng)。

按住Shift鍵，使用向上和向下箭頭鍵盤鍵沿屏幕Y軸移動(dòng)。

選擇“View-> Molecule Positioning-> Tools ...”菜單項(xiàng)以使用“Molecule Positioning Tools”對(duì)話框。

12、如何在我選擇的空間中獲得電子密度，電子密度的拉普拉斯算子和其他函數(shù)的值，而不僅僅是關(guān)鍵點(diǎn)?

運(yùn)行程序AIMExt并使用主菜單選項(xiàng)(5)，“輸入坐標(biāo)處的屬性”。感興趣的數(shù)據(jù)將在.extout文件中。

13、如何定位和表征維里場(chǎng)或其他功能的關(guān)鍵點(diǎn)?

在運(yùn)行AIMQB時(shí)，始終自動(dòng)計(jì)算電子密度的所有臨界點(diǎn)。當(dāng)運(yùn)行AIMQB時(shí)，對(duì)于一些或所有原子，可任選地自動(dòng)計(jì)算電子密度的拉普拉斯算子的臨界點(diǎn)。對(duì)于其他電子密度和電子密度的拉普拉斯算子(例如，維里場(chǎng))的函數(shù)，直接運(yùn)行程序AIMExt并回答“你想要分析的主要功能是什么?”的問題。因此。然后使用主菜單選項(xiàng)(如(6))搜索主要功能的關(guān)鍵點(diǎn)。感興趣的數(shù)據(jù)將在.extout文件中。

14、我可以在AIMStudio 3D窗口中隱藏單個(gè)原子，鍵合路徑，BCP等嗎?

是。右鍵單擊任何核，BCP，RCP，CCP，NNACP，Ghost或其他對(duì)象范圍將推送具有該對(duì)象特定的各種選項(xiàng)(位于菜單頂部)的上下文菜單。其中一個(gè)選項(xiàng)是“Cloak Object”。隱藏對(duì)象將隱藏它(使用更通用的術(shù)語(yǔ)“披風(fēng)”而不是“隱藏”以允許將來可能的“隱形”的不同表示)。隱藏BCP也會(huì)掩蓋其債券路徑及其IAS EV路徑。隱藏RCP也會(huì)隱藏其RCP到BCP路徑。請(qǐng)注意，隱藏的對(duì)象無法通過右鍵單擊它(因?yàn)樗辉俅嬖?，但是所有隱藏的對(duì)象都可以通過“View-> Decloak All”菜單項(xiàng)去除。隱形修補(bǔ)對(duì)于非平面分子中的等高線圖和其他2D圖特別有用，

15、有沒有辦法讓AIMAll對(duì)它產(chǎn)生的所有數(shù)值數(shù)據(jù)進(jìn)行排序和/或過濾?

是。AIMStudio現(xiàn)在提供可定制的原子表， BCP表，RCP表，CCP表等，它們與相應(yīng)的3D窗口交互，并允許用戶以各種方式查看，排序，復(fù)制和打印屬性數(shù)據(jù)。

16、.sum文件，.mgp文件，.extout文件和其他AIMAll結(jié)果文件中給出的長(zhǎng)度，能量，電子密度等單位是多少?

AIMAll中的長(zhǎng)度單位是原子單位(bohr)。AIMAll中的能量單位是原子單位(Hartree)。AIMAll中的電子密度單位是原子單位(e / bohr ^ 3)。如在每個(gè).sum文件的頂部附近所述，除非另有說明，否則來自(和輸入數(shù)據(jù))AIMAll的所有輸出數(shù)據(jù)都是原子單位。

17、AIMExt是否計(jì)算并打印Cremer和Kraka能量密度H(r)?

Cremer和Kraka能量密度H(r)= G(r)+ V(r)等于-K(r)，即減去電子動(dòng)能密度的哈密頓形式。K(r)由AIMExt在電子密度的關(guān)鍵點(diǎn)(例如BCP)計(jì)算，該數(shù)據(jù)可在.sum文件，.sumviz文件，.mgp文件和.mgpviz文件中獲得。與所有其他CP屬性一樣，K(r)值可以在AIMStudio中以表格形式和/或在3D窗口中查看。與電子密度，電子密度的拉普拉斯算子等一樣，函數(shù)K(r)本身可以使用AIMExt進(jìn)行拓?fù)浞治觥？梢允褂肁IMStudio顯示K(r)的輪廓圖，浮雕圖和等值面。

18、AIMAll會(huì)計(jì)算原子電子自旋數(shù)嗎?

是。原子數(shù)N_alpha(A)，N_beta(A)，N_total(A)和N_spin = N_alpha(A) - N_beta(A)被打印在原子積分結(jié)果文件(.int文件)的末尾附近以及其他原子電子旋轉(zhuǎn)屬性，如電子自旋動(dòng)能，電子自旋矩等。原子自旋群也列在.sum文件和.sumviz文件的末尾，可在AIMStudio 3D窗口和Atom表中查看。這里顯示了苯氧基中的原子電子自旋值N_spin(A)的圖片。

19、AIMAll是否計(jì)算對(duì)NICS的原子貢獻(xiàn)(“Nucleus Independent Chemical Shielding”)?

是的，只要你有適當(dāng)?shù)牟ê瘮?shù)來計(jì)算原子磁響應(yīng)特性。要計(jì)算NICS屏蔽張量及其原子貢獻(xiàn)，只需將“Ghost nuclei”的坐標(biāo)添加到波函數(shù)文件中，以便計(jì)算要計(jì)算NICS貢獻(xiàn)的每個(gè)點(diǎn)。對(duì)于每個(gè)鬼核，確保添加一個(gè)合適的核名稱(必須以Bq開頭，例如，Bq13)，原子序數(shù)(0)和電荷(0.0)，并確保增加核數(shù)量的值。鬼核補(bǔ)充說。

20、如何獲得BCP與RCP，核心和BCP等之間的距離?我可以獲得我感興趣的關(guān)鍵點(diǎn)的角度和二面角數(shù)據(jù)嗎?

對(duì)于通過鍵路徑連接的原子核(NACP)，原子核(NACP)與原子核(NACP)之間的距離與其共享鍵臨界點(diǎn)的距離寫入.mgp，.mgpviz，.sum和.sumviz文件并可以在AIMStudio中顯示為BCP長(zhǎng)度屬性。鍵合路徑角度和相應(yīng)的幾何鍵角也寫入這些文件。涉及任何主要點(diǎn)對(duì)象(即，核，BCP，RCP，CCP，NNACP，Rho CP和Ghost的拉普拉斯算子)的距離，角度和二面角可以通過選擇(點(diǎn)擊)3D窗口中的對(duì)象球體從AIMStudio獲得。通過“工具 - >選擇表...”菜單項(xiàng)顯示所選對(duì)象的距離表，角度表和二面角表。